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protein diffusion model 관련 영상 https://youtu.be/L_PcZaXjip0 더보기
torch dataloader 사용법 import torchfrom torch import nn, optimfrom sklearn.datasets import load_irisfrom torch.utils.data import TensorDataset, DataLoaderiris = load_iris()X = iris.data[:100]y = iris.target[:100]X = torch.tensor(X, dtype=torch.float32)y = torch.tensor(y, dtype=torch.float32)# X와 Y를 결합할 때는 아래와 같이 사용.ds = TensorDataset(X, y)loader = DataLoader(ds, batch_size=10, shuffle=True)net = nn.Linear(4, 1)loss_f.. 더보기
인간 단백질 내 아미노산 빈도 (amino acid frequency in human proteins) 𝑝⁡(𝐴) =0.0777𝑝⁡(𝐶) =0.0157𝑝⁡(𝐷) =0.053𝑝⁡(𝐸) =0.0656𝑝⁡(𝐹) =0.0405[0.0704][0.0231][0.0484][0.0692][0.0378]𝑝⁡(𝐺) =0.0691𝑝⁡(𝐻) =0.0227𝑝⁡(𝐼) =0.0591𝑝⁡(𝐾) =0.0595𝑝⁡(𝐿) =0.096[0.0675][0.0256][0.0450][0.0565][0.0984]𝑝⁡(𝑀) =0.0238𝑝⁡(𝑁) =0.0427𝑝⁡(𝑃) =0.0469𝑝⁡(𝑄) =0.0393𝑝⁡(𝑅) =0.0526[0.0237][0.0368][0.0610][0.0465][0.0552]𝑝⁡(𝑆) =0.0694𝑝⁡(𝑇) =0.055𝑝⁡(𝑉) =0.0667𝑝⁡(𝑊) =0... 더보기
아미노산 화학그룹 (chemical group of amino acids) amino_acids_group={        'Acidic':['D','E']        ,'Basic':['R','H','K']        ,'Polar':['S','T','N','Q']        ,'Special':['C','G','P']        ,'Hydrophobic':['A','V','I','L','M','F','Y','W']} 더보기
[mnist] Anomaly detection에서의 boosting 기법 효과 1. 개요 이상치 탐지 (anomaly detection) 중 비지도 이상치 탐지는 주로 정상 데이터만 있는 경우에 자주 사용되는 기법임. 문제는 비지도 학습의 경우 지도학습에 비해 성능이 다소 떨어지는 것이 사실임. 이러한 문제를 boosting 기법을 적용하면 좀 더 성능이 향상될지가 궁금했음. 2. 방법a) mnist 데이터셋에 대해 각 숫자들을 정상으로 두고 나머지는 비정상으로 두는 방식으로 인위적인 normal/abnormal 데이터셋을 만듬. 훈련데이터의 abnormal은 validation set으로 사용하여 autoencoder 모델의 ROC-AUC값이 최대치에 다다르면 해당 모델을 사용하도록 만듬.b) 편의상 single model이나 ensemble model이나 모델의 형태는 동일하게.. 더보기
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