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R관련

CBS, DNAcopy

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https://www.biostars.org/p/10860/ 


CNA(genomdat, chrom, maploc, sampleid)

genomdat : numeric matrix임

chrom : 각 row별 chromosome

maploc : 각 row별 marker position

sampleid : 각 column별 sample의 이름


smooth.CNA()

log2ratio를 smoothing시켜줌


segment(x)

CBS(circular binary segmentation)으로 segmentation시켜줌


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