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특정 gtf와 reference genome을 다운로드 받음
0. HTS lib다운로드
http://www.htslib.org/download/
tar -xvf htslib-1.5.tar.bz2
cd htslib-1.5
make
sudo make install # 또는 ./bgzip 을 쓰면 사용가능함.
GTF사용 준비
/home/sjoh/hg38/htslib/htslib-1.5
grep -v "#" data.gff | sort -k1,1 -k4,4n -k5,5n -t$'\t' | bgzip -c > data.gff.gz
tabix -p gff data.gff.gz
./vep -i input.vcf -gff data.gff.gz -fasta genome.fa.gz
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