본문 바로가기

R관련

biomaRt connection관련

728x90
반응형

가끔 업데이트나 버그 등으로 GRCH37 등의 ensembl이용이 불가능한 경우가 있으면 다음과 같이하면됨

http://grch37.ensembl.org/biomart/martview 들어가서 접속되는지 확인 [되든 안되든 안되면 아래의 명령어 실행]


ensembl_75 = useMart(biomart="ENSEMBL_MART_ENSEMBL", host="feb2014.archive.ensembl.org", path="/biomart/martservice", dataset="hsapiens_gene_ensembl")


또는 최신버전으로 깔면됨.

BiocInstaller::biocLite('grimbough/biomaRt')

728x90
반응형