BEDtools 설치법

1. 주의사항

 특정 목적이 있어서 좀 오래된 버전을 기준으로 적는다. 그러나 설치법은 동일하다.

 

2. 다운로드를 받고 압축을 풀어준다.

# 다운로드
wget https://storage.googleapis.com/google-code-archive-downloads/v2/code.google.com/bedtools/BEDTools.v2.17.0.tar.gz

# 압축풀기
tar -zxvf BEDTools.v2.17.0.tar.gz

 

3. 컴파일한다.

 cd bedtools-2.17.0 && make
 
 # 테스트를 진행한다.
 make test

 

4. 설치가 잘됐으면 bin폴더 내의 파일들을 /usr/local/bin으로 옮겨준다. 

만일 root권한이 아니라면 ~/bin/으로 한다.

cp bin/* /usr/local/bin/

 

5. bedtools가 잘 작동되는지 확인한다.

cd .. && bedtools | less