생물정보학 혼자 시작할 때 좋은 무료 자료

DIY Transcriptomics

https://diytranscriptomics.com/

DIY.transcriptomics – RNAseq course.

직접 따라할 수있는 데이터와 스크립트를 제공해주는 RNAseq분석에 대한 강의이다.

서열 매핑/정렬 (alignment)와 정량 (quantification) 그리고 Gene-ontology분석까지 다양한 RNA-seq데이터 분석들을 다룬다.

DIY.transcriptomics 홈페이지

 

YouTube (Manolis Kellis, Aaron Quinlan)

https://www.youtube.com/c/ManolisKellis1/videos

Manolis Kellis

 

MIT에서 컴퓨터 과학과에 재직 중인 Manlois Kellis 교수의 채널이다. 생명과학을 전공하는 사람들이 들으면 좋은 생명정보학 강의들이 많다. 특히 요즘 핫한 딥러닝을 활용한 수업도 많이 올라와 있다.

Manolis Kellis 유튜브 채널

 

A Primer for Computational Biology

https://open.oregonstate.education/computationalbiology/

https://l.facebook.com/l.php?u=https%3A%2F%2Fopen.oregonstate.education%2Fcomputationalbiology%2F%3Ffbclid%3DIwAR3ZGKRPXH6wCU4BF2yzkpAmr9GK__O25NC1X5aOUv2IjxmWYFlY_GNqY2E&h=AT3p-IbJoWqqYxkpuESmSabuLMz_TpKuJEe-5DFGmFcJmvavm_X8F9z8IlFmdjpxK0UEyyEVSgSoE4wq6RAXkvukHGh4vCOuaIpn5cohbvZq2Xh_Hbd6OuImATHuAtinan6sRHkSNQonPkf2A4i0MjWlYfrMYOVIzWwXU5M_TBiBq4A2yhDW5tOp2ZZmDuRYUCRqxIDZs_zSj8vw2jNlVylFHUCjt7flxa8ZVZZF9IxtHY9XYInTN12F5hRuxU7UD36SoaAHoUsqAg0xPKT-6bfKfzrJYBSA

프로그래밍만 가르쳐주는 computational biology 사이트이다. 기본적인 linux/python/r에대한 교육이 담겨있고 예시가 생물로된 프로그래밍 입문서라고 보면 된다. 처음 시작하게 될 때 사용하면 괜찮을거 같다.

A Primer for Computational Biology 홈페이지

 

 

Sandbox.bio

https://sandbox.bio/

sandbox.bio

samtools, bedtools, awk 같은 주요 프로그램들을 WebAssembly로 컴파일해서 웹브라우저에서 실습할 수 있게 만들어 둔 튜토리얼 사이트이다. 환경셋업이 필요없이 모든게 준비된 상태로 나온다. 완전 처음 입문하는 분들에게 추천하기에 좋다.

sandbox.bio 홈페이지

출처는 아래 사이트에서 가져왔으며 유료 강좌이거나 강좌가 겹치는 것으로 보이는 것들은 제외했다.

장혜식 박사 페이스북 (https://www.facebook.com/hyeshik)