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Bioinformatics(생정보학)

single-cell RNAseq annotation benchmark

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https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-019-1795-z

 

A comparison of automatic cell identification methods for single-cell RNA sequencing data - Genome Biology

Background Single-cell transcriptomics is rapidly advancing our understanding of the cellular composition of complex tissues and organisms. A major limitation in most analysis pipelines is the reliance on manual annotations to determine cell identities, wh

genomebiology.biomedcentral.com

svm model로 확률 70%미만을 고르는 것이 가장 성능이 좋은 것으로 추천하고 있음.

해당 모델은 svm-rejection으로 명명되어있음.

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