linux(리눅스) 썸네일형 리스트형 echo를 이용해 multiple line을 넣는 법 echo $'넣1\n넣2\n' >> 수정하고 싶은 파일 더보기 copy (cp)를 강제로 하는 방법 \cp -rf ./test ../data/test \를 넣게 되면 alias 기능이 무력화됨 더보기 영상관련 유용한 것들 pitivi (동영상 편집기) sudo apt-get install pitivihttps://askubuntu.com/questions/698050/pitivi-poor-video-quality simplescreenrecoder (화면 저장기) sudo apt-get install simplescreenrecorder 더보기 sublime text sublime txt는 linux에서 인기 있는 개발자 용 tool입니다. 설치 방법은 다음과 같습니다. sublime text2 sudo add-apt-repository ppa:webupd8team/sublime-text-2 sudo apt-get update sudo apt-get install sublime-textsublime text3 sudo add-apt-repository ppa:webupd8team/sublime-text-3 sudo apt-get update sudo apt-get install sublime-text-installer 더보기 특정 문자열을 갖는 row만 뽑아내기/제거하기 (grep) grep -w '패턴' 파일 > 결과물-w : 글자 전체가 정확하게 일치하는 것만 뽑아냄.예를들어 DD를 넣으면 DD1X는 안뽑힘 -x : 전체 line이 일치해야 뽑아냄.-e : 패턴이 일치하면 뽑아냄. -w와 달리 일부만 일치하면 됨. grep -v '패턴' 파일 > 결과물-v : 해당 패턴을 제외한 것을 뽑아냄.Invert the sense of matching, to select non-matching lines. (-v is specified by POSIX.) 여러개의 패턴들로 row뽑아내기 grep -fw '패턴 파일' 파일 > 결과물Interpret the pattern as a list of fixed strings (instead of regular expressions), separa.. 더보기 sed와 awk 사용법 sed 파일에서 특정 문자열을 가진 line을 없애버리기 sed '/없애버릴 글자/d' 파일 > 결과물 만일 변수를 넣을 경우면 double quote를 사용해야함sed "/$variable/d" "$files" > 결과물 파일에서 특정 행 (specific line number)를 제거하고 싶을 때,sed -e '5,10d;12d' 파일 5번부터 10번까지와 12번을 제거할 때임. 파일에서 특정 행들을 추출하고 싶을 때, sed -n 5,10p;12p 파일 5번부터 10번까지와 12번을 뽑을 때임 파일의 특정 line(row)에 삽입하고 싶을 때,sed -i "15i 넣고싶은문자" Makefile.txt-i : overwrite하란 소림15 : 15번째 row(line) 파일 전체에서 특정 문자를 다른.. 더보기 특정 column만 뽑아내는 법 cat Homo_sapiens.GRCh37.74.gtf | cut -f9 | cut -d' ' -f2 > res cut은 기본적으로 tab 구분자로 진행함. -f 뒤의 수는 몇 번 째 column을 뽑을지 지정하는 것임-d' ' 는 space단위로 자르라는 것 sort res | uniq > res2 텍스트에서 uniq한 것만 뽑아내는 법https://unix.stackexchange.com/questions/11939/how-to-get-only-the-unique-results-without-having-to-sort-data 37.67 : 5765937.68 : 5957337.69 : 6038637.71 : 61893 37.72 : 62893 37.73 : 63152 37.74 : 6367737.7.. 더보기 for문으로 프로그램 돌리기 리눅스 #!/bin/bash # This is to run variant effect predictor version 37.75 indir=/mnt/yonsei/project/sjoh/vcf/vcfb12 # input directory outdir=/mnt/yonsei/project/sjoh/vcf/v75/ # Output directory tail='_vcf37_75.vcf' for x in $indir/*.vcf do echo $x y=${x##*/} #indir의 path를 지워줌 echo $outdir$y echo 'z' z=${y%_unfiltered.*} # 파일의 특정부분 뒷부분을 지움 별표된 부분을 지워줌. echo $z$tail perl /mnt/tools/vep/ensembl-tools-rel.. 더보기 이전 1 2 3 4 다음