Samtools 설치법

1. 주의사항

 여기서 서술된 것은 좀 오래된 버전을 다운 받아서 하는 것부터 진행된다. 최신 버전은 git-hub에 들어가서 다운받아서 하면 된다. 버전에 따른 데이터를 다운 받는 것이 다를 뿐 나머지 설치과정은 동일하다.

 

2. 다운로드를 받고 압축을 풀어준다. 여기서 보여주는 것은 오래된 samtools 버전이다.

# 다운로드
wget https://sourceforge.net/projects/samtools/files/samtools/0.1.19/samtools-0.1.19.tar.bz2

# 압축풀기
tar -xf samtools-0.1.19.tar.bz2

 

3. make를 통해 컴파일을 해준다.

# 경로 이동 및 samtools make
cd samtools-0.1.19 && make

 

4. samtools를 편히 사용할 수 있게 경로를 외부로 빼준다 (export path)

# samtools 구동을 위한 파일들의 경로를 빼준다.
export PATH=$PATH:/home/Samtools/samtools-0.1.19

# samtools 실행파일을 /usr/local/bin으로 복사해준다.
cp /home/Samtools/samtools-0.1.19/samtools /usr/local/bin/samtools

 

5. samtools가 설치되지 않은 경로에서 samtools를 시험삼아 실행해본다.

cd .. && samtools

성공